Sondas fluorescentes revelam com maior nitidez o dobramento do ADN em células vivas

Investigadores liderados pelo Centro de Regulação Genómica de Barcelona desenvolveram sondas fluorescentes que revelam como o ADN se compacta e se move dentro de células vivas. As moléculas, chamadas HoTs, produziram imagens com uma resolução de 20 nanómetros em células vivas e localizaram moléculas individuais de corante com uma precisão de três nanómetros em células laboratoriais preservadas, próxima da largura do próprio ADN.

As sondas atravessam as membranas celulares, ligam-se ao ADN e alternam espontaneamente entre estados luminosos e escuros. Microscópios avançados conseguem localizar separadamente as moléculas que piscam e depois combinar as suas posições por meios computacionais numa imagem detalhada. Em células vivas, o método evita os produtos químicos agressivos e a luz laser intensa exigidos por muitas técnicas existentes de análise de moléculas individuais.

Quando aplicadas a secções de tecido intestinal de três pessoas com cancro, as sondas mostraram que o ADN das células tumorais era menos compacto e mais disperso do que no tecido saudável vizinho. A descoberta foi consistente com investigações anteriores, embora o estudo não tenha estabelecido por que razão ocorre esta alteração nem a tenha validado como indicador de diagnóstico.

Num teste separado, um sistema de inteligência artificial distinguiu células vivas da pele de células estaminais com uma precisão de 96 a 98%, analisando as diferenças no dobramento do seu ADN. As sondas marcam todo o genoma, e não genes específicos, mas o trabalho, publicado na Molecular Cell, oferece uma nova forma de estudar a arquitetura da cromatina em movimento.