Un atlas global inventariază aproape 55.000 de virusuri ARN din orașe și împrejurimile lor

Oamenii de știință au creat un catalog global cu 54.945 de virusuri ARN găsite în medii urbane și periurbane, dintre care aproximativ 77% nu fuseseră documentate anterior. UPVAtlas oferă o bază de referință neobișnuit de amplă pentru studierea comunităților virale în mare parte neexplorate care ne înconjoară, fără a sugera că aceste virusuri reprezintă noi amenințări pentru sănătate.

Studiul internațional, publicat în Nature Communications, a examinat 2.922 de probe din 102 orașe din 31 de țări. Cercetătorii au analizat material genetic de pe suprafețe atinse frecvent, precum balustrade, bănci și automate de bilete, alături de probe din ape uzate, sol, sedimente, ape dulci și sere. Secvențierea metatranscriptomică și instrumentele bioinformatice au permis echipei să sorteze milioane de fragmente de ARN și să identifice secvențe virale fără a căuta doar organisme cunoscute ca agenți patogeni.

O posibilă gazdă a putut fi propusă doar pentru aproximativ o treime dintre secvențe. Mai mult de jumătate dintre secvențele din acest grup corespundeau unor virusuri care infectează bacterii, ceea ce evidențiază cât de puține dintre virusurile catalogate pot fi asociate în prezent cu infecții umane. Cercetătorii au identificat și 166 de bacteriofagi despre care se știe că au infectat bacterii importante din punct de vedere clinic, oferind candidați pentru viitoare studii privind terapia cu fagi și rezistența la antibiotice.

Apele uzate au prezentat unele dintre cele mai ridicate niveluri de diversitate virală, consolidând potențialul lor pentru supravegherea mediului. Deoarece ritmul descoperirilor nu începuse să se plafoneze pe măsură ce erau analizate mai multe probe, atlasul surprinde probabil doar o parte din diversitatea existentă. Prelevările viitoare pot arăta acum cum se schimbă în timp comunitățile virale urbane.