
科学与发现
全球图谱收录城市及周边近5.5万种RNA病毒
科学家建立了一份全球名录,收录在城市和城郊环境中发现的54,945种RNA病毒,其中约77%此前未被记录。UPVAtlas为研究人们周围尚未得到充分探索的病毒群落提供了覆盖范围格外广泛的基线,但这并不意味着这些病毒构成新的健康威胁。
这项发表于《自然·通讯》的国际研究分析了来自31个国家102座城市的2,922份样本。研究人员分析了扶手、长椅和售票机等经常被触碰的表面上的遗传物质,同时也分析了污水、土壤、沉积物、淡水和温室样本。借助宏转录组测序和生物信息学工具,团队得以对数百万个RNA片段进行分类并识别病毒序列,而不局限于寻找已知致病生物。
仅约三分之一的序列能够推测出可能的宿主。在这一部分中,超过一半是感染细菌的病毒,凸显出目前名录中能与人类感染联系起来的病毒十分有限。研究人员还识别出166种有感染临床重要细菌记录的噬菌体,为今后研究噬菌体疗法和抗生素耐药性提供了候选对象。
污水样本的病毒多样性位居前列,进一步凸显了其在环境监测中的潜在价值。随着分析样本的增加,新发现的数量尚未开始趋于平稳,因此这份图谱很可能只涵盖了实际病毒多样性的一小部分。以此为基础,今后的采样可以揭示城市病毒群落如何随时间变化。